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O Provoc divide-se em duas etapas: Iniciação e Avançado. A etapa de Iniciação tem como objetivo familiarizar os alunos com as principais técnicas e objetos de pesquisa de C&T. Os alunos assumem a execução de atividades, supervisionados por seus orientadores. A duração dessa etapa é de 12 meses.

No Avançado, o objetivo é possibilitar a aprendizagem de todas as fases de execução de um projeto de pesquisa em C&T. Dessa forma, a experiência estende-se desde a elaboração do projeto até a difusão dos resultados em eventos científicos e através de publicações. É uma etapa mais longa, durando 21 meses.

Cerca de 33% dos alunos que fazem a etapa de Iniciação passam para o Avançado, um percentual que se mantém ao longo da história do Provoc. Embora a maioria demonstre interesse em continuar no Programa, um dos principais motivos que leva à não continuação na etapa do Avançado é o excesso de atividades escolares e as exigências do pré-vestibular.